トップページ    イベント・広報    R-CCS Cafe    R-CCS Cafe 第216回 第1部

講演題目

AI and Molecular Dynamics Simulation Study of Cyclic Peptides

詳細
開催日 2021年9月10日(金)
開催時間 16:00 - 16:20(16:40 - 17:00 講演者を交えたフリーディスカッション、17:00 - 自由討論(参加自由))
開催都市 オンライン
場所

BlueJeansによる遠隔セミナー

使用言語 発表・スライド共に英語
登壇者

山根努

HPC/AI駆動型医薬プラットフォーム部門 上級研究員

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講演要旨

I have been researching to clarify the relationship between protein structure and function through molecular dynamics simulations of proteins. Two years ago, I joined RIKEN, and I have been investigating drug discovery using AI and molecular simulation. I am studying a type of peptide molecule called cyclic peptides, which belongs to a medium-sized molecule. Cyclic peptides can act as inhibitors of protein-protein interactions that conventional small-molecule drugs cannot target. Furthermore, since some cyclic peptides are membrane-permeable, they can be involved in intracellular protein-protein interactions, which expect to expand the range of strategies in drug discovery. Therefore, clarifying the mechanism of the membrane permeation process of cyclic peptides and developing the prediction system of membrane permeability is essential for drug discovery. In the R-CCS Café, we will discuss the development of force fields for molecular simulation of cyclic peptides and molecular dynamics simulation of membrane permeation process of the cyclic peptide using the force field.

注意事項

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(2021年8月31日)