理化学研究所 計算科学研究センター

メニュー
メニュー

第200回 第2部

第200回 第2部
日時: 2020年10月9日(金)、16:40 - 17:00
(17:20 - 17:40 講演者を交えたフリーディスカッション(冒頭に1-2分の小休止を挟みます))
場所: BlueJeansによる遠隔セミナー

・講演題目:Demonstration of 3D-reconstruction algorithm for single particle analysis using X-ray free electron laser
・講演者:中野 美紀(計算構造生物学研究チーム)
※発表・スライド共に英語

講演要旨: 詳細を見る

In order to analyze the functions and interactions of biomolecules at the molecular level, it is necessary to elucidate the detailed three-dimensional (3D) structure of biomolecules. Single-particle 3D structure analysis using X-ray free electron laser (XFEL) is a new structural biology technique that allows observation of biomolecular complexes and tissues that are difficult to crystallize in a state close to nature. However, even using intensive XFEL beam, diffraction intensity obtained from a single biomolecule is still weak, and the S/N ratio of the diffraction pattern is small. In order to restore the 3D structure with the expected resolution, it is necessary to estimate the requirement for the quantity and quality of the diffraction patterns. For this purpose, we tried to reconstruct the 3D structure of ribosome using the simulation diffraction pattern sets, consisting of the different number of patterns created by different beam intensities. In this presentation, I will show how the resolution of the reconstructed 3D structure depends on the quantity and quality of the diffraction patterns, which indicate the minimum requirement of XFEL experimental conditions to obtain the diffraction patterns to reconstruct the molecular structure with several nanometers resolution. Also, I will introduce our recent results of restoration of 3D-structure of gold nano-particle from the diffraction patterns obtained by XFEL experiment.

注意事項:
・参加の際はPCマイクの音声・ビデオをオフにされるようお願いいたします。
・当日の会場環境や通信状態により、やむなく配信を中止・中断する場合がございます。
・プログラムの内容、時間は予告なく変更される場合があります。
・ご使用の機器やネットワークの環境によっては、ご視聴いただけない場合がございます。
・インターネット中継に関する著作権は、主催者及び発表者に帰属します。なお、配信された映像及び音声、若しくはその内容を、理化学研究所の許可無くほかのウェブサイトや著作物等への転載,複製,改変等を行うことを禁じます。