[hagita]

GENESIS開発チーム、小林様、

お世話になっております。
レスポンスが遅くなり申し訳ありません。

インタラクティブノードにて、
compileを、ln -s /usr/share/automake-1.16/compile として、
autoreconf した後に、
フロントエンドで、クロスコンパイラ環境でmakeまで実施しました。
（前回は、インタラクティブノードでコンパイルしました。）

インタラクティブノードにて、
export OMP_NUM_THREADS=6
export PARALLEL=6
mpiexec -n 8 -stdout-proc ./out/%j/out -stderr-proc ./out/%j/err ../../genesis-2.0-master-DEBUG/bin/spdyn step4.1-R.inp
を実行しました。

エラーなしで、dcdファイルを作るところまで、動作しました。

従いまして、最初の１回の所なので、オリジナルのままで動作する
ことが確認できました。お手数をお掛けしました。

どうぞよろしくお願いします。

萩田

P.S.
大規模なデータを扱うために、
src/lib/fileio_grocrd.fppなどで、
　旧： read(file,'(i5,a5,a5,i5,3f8.3,3f8.3)’)
新： read(file,'(i5,a5,a5,i8,3f8.3,3f8.3)’)
　旧： write(file,'(i5,a5,a5,i5,3f8.3,3f8.3)’)
　新： write(file,'(i5,a5,a5,i8,3f8.3,3f8.3)’)
のように、変更しております。
上記の変更をしない場合は、下記のエラーが表示されます。
（今回の問題とは、直接関係ないと思っています。）
＝＝＝＝
jwe0173i-w line 317 Invalid decimal character . was detected (unit= 7).
(the relative position causing an error in a record = 50 )
1R01 C_15 1 52.701 36.824 45.630 -0.001 -0.000 0.000
?
error occurs at fileio_grocrd_mod.read_grocrd_ line 317 loc 0000000002faf450 o
ffset 0000000000001838
fileio_grocrd_mod.read_grocrd_ at loc 0000000002fadc18 called from loc 000
0000002faac9c in fileio_grocrd_mod.input_grocrd_ line 82
fileio_grocrd_mod.input_grocrd_ at loc 0000000002faa4f4 called from loc 000
0000001e6fbf8 in sp_input_mod.input_md_ line 471
sp_input_mod.input_md_ at loc 0000000001e6648c called from loc 000
00000027f0f58 in sp_setup_spdyn_mod.setup_spdyn_md_ line 168
sp_setup_spdyn_mod.setup_spdyn_md_ at loc 00000000027e6414 called from loc
0000000002971420 in spdyn.domain_decomposition_genesis_ line 309
spdyn.domain_decomposition_genesis_ at loc 000000000296f1dc called from loc
000000000296e72c in MAIN__ line 122
MAIN__ at loc 000000000296da6c called from o.s.
taken to (standard) corrective action, execution continuing.
＝＝＝＝

[hagita]

GENESIS開発チーム、小林様、

お世話になっております。

この１カ所を通過すれば、問題なく動作しております。

164行目を if (.not. allocated(pairlist%num_nb15_calc1)) &
と元に戻して、実行した際のログを取得すればよろしいでしょうか？

ログ取得の前に、確認させてください。

どうぞよろしくお願いします。

萩田

[hagita]

GENESIS 開発チーム　小林様、

ありがとうございます。
Ｖｅｒ２での利用を検討させていただきます。
今後とも、どうぞよろしくお願いします。

萩田