[isaka]

お世話になっております，井阪@神戸医療産業都市推進機構です．

Gromacs Topologyを利用し，GENESISでの計算を行いたいのですが，

grocrdfile/groreffileに指定するGromacs上での出力ファイルはどのファイルに該当，

ならびにどのファイル形式ですとGENESISで読み込みが可能でしょうか？

以上よろしくお願い申し上げます

[ckobayashi]

井阪様

御返答が遅れまして申し訳ございません。

grocrdfile/groreffileともにgromacsでの座標ファイル”.gro”ファイルに相当します。

http://manual.gromacs.org/documentation/2018/user-guide/file-formats.html#gro

#速度部分は読み込み自体はいたしますが、MD計算では利用しません。

よろしくお願いいたします。

GENESIS開発グループ　小林

[isaka]

小林様

groファイルを指定し，Gromacsトポロジーからのミニマイズ計算ができました！

ありがとうございます．

今後とも宜しくお願い申し上げます．